นินจาเงินเดือนแห่งโคโนฮะ ทำไมพวกห้าคาเงะต้องมาขอร้องให้ข้าช่วยกู้โลก

ชิมูระ คิซารุ ผู้ข้ามมิติมายังโลกนินจาพร้อมกับระบบตัวช่วยพิเศษ เขาตัดสินใจเปลี่ยนเส้นทางชีวิตจากนินจาธรรมดาในตระกูลชิมูระ สู่การเป็นอัจฉริยะสัตว์ประหลาดที่โลกต้องจารึก ด้วยการครอบครองความสามารถของพลเอกคิซารุแห่งกองทัพเรือจากเรื่องวันพีซ เขาเริ่มต้นชีวิตใหม่ในหมู่บ้านโคโนฮะด้วยเป้าหมายที่เรียบง่าย คือการหางานที่มั่นคงและมีสวัสดิการดี แต่พรสวรรค์ที่เหนือชั้นเกินบรรยายกลับดึงเขาเข้าสู่จุดสนใจของเหล่าเบื้องบนอย่างชิมูระ ดันโซ และซารุโทบิ ฮิรุเซ็น
เรื่องราวการเดินทางของคิซารุจึงกลายเป็นการผสมผสานระหว่างการชิงไหวชิงพริบในโลกนินจา การฝึกฝนพลังอันไร้ขีดจำกัดจากผลปีศาจแสง และแผนการลับที่จะนำพาเขาไปสู่ตำแหน่งโฮคาเงะตามความปรารถนาของตระกูล โดยมีเดิมพันเป็นอนาคตของหมู่บ้านที่กำลังเข้าสู่ยุคแห่งสงครามที่ไม่อาจหลีกเลี่ยงได้